Hvis der er en høj pH-værdi i vådfoderet (over 5,0) og der er problemer med lav foderoptagelse eller der opstår voldsomme diarréproblemer eller pludselige dødsfald, bør der sendes mindst én vådfoderprøve til mikrobiologisk analyse f.eks. på Det Jordbrugsvidenskabelige Fakultet (DJF) i Foulum. Mikrobiologisk laboratorium, DJF skal kontaktes inden prøven udtages. Prøven udtages fra en tilfældig foderventil under udfodring (se afsnit om vejledning i udtagning af prøver nedenfor).
Prøverne bør analyseres for pH, mælkesyresyrebakterier, enterobakterier, gær, skimmel, Clostridium perfringens, mælkesyre, eddikesyre, myresyre og ethanol. Normalindhold i vådfoder, hvor kvaliteten anses for at være god, er vist i tabel 1.
Tabel 1. Normalværdi for pH og normalindhold af mikroorganismer, organiske syrer samt ethanol i vådfoder.
| pH |
4,5 - 5,0 |
| Mælkesyrebakterier |
108 - 109 CFU pr. g vådfoder |
| Gær |
106 - 107 CFU pr. g vådfoder |
| Enterobakterier |
Under 103 - 104 CFU pr. g vådfoder |
| Skimmel |
Under 103 CFU pr. g vådfoder |
| Clostridium perfringens |
Under 102 CFU pr. g vådfoder |
| Mælkesyre |
40 - 150 mmol pr. kg vådfoder |
| Eddikesyre |
10 - 50 mmol pr. kg vådfoder |
| Myresyre |
0 - 40 mmol pr. kg vådfoder |
| Ethanol |
0,1 - 4 g pr. kg |
CFU = colony forming units
Hvis der findes et højt indhold af enterobakterier (over 10 millioner (=107) pr. g ), der blandt andet omfatter coliforme bakterier, bør anlægget tømmes og rengøres. Hvis der findes enterobakterier i vådfoderet, men på et lavere niveau end 107 pr. g, eller hvis der findes skimmel (over 1000 (= 103) pr. g) eller Clostridium perfringens (over 100 (=102) pr. g) i vådfoderet, skal der gøres en ekstra indsats for at rengøre tank og tilførselsrør. Tank og tilførselsrør skal rengøres hhv. hver og hver anden uge (se vådfodermanagement). Skimmel kan producere toksiner, der kan give tarmblødning og dermed pludselig dødsfald eller udskudt endetarm. Enterobakterier eller Clostridium perfringens kan give diarré.
I vådfoder skal de dominerende mikroorganismer være mælkesyrebakterier og gær. Et højt indhold af gær kan dog give problemer med CO2- produktion og højt indhold af ethanol. Mælkesyrebakterierne producerer mælkesyre, der sænker pH. Normalindholdet af mælkesyre i vådfoder er 40-150 mmol pr. kg vådfoder (svarende til 4-14 promille). Indholdet af eddikesyre skal være væsentligt lavere end indholdet af mælkesyre, da et højt indhold af eddikesyre (over 90 mmol pr. kg) kan give en dårlig smag af foderet. Myresyre produceres kun i meget begrænset mængde i vådfoder, så et højt indhold af myresyre (over 10 mmol pr. kg) viser, at der er tilsat myresyre til foderet f.eks. via valle. Der bør ikke tilsættes mere end 2 promille myresyre til fodersuppen. svarende til 43 mmol pr. kg vådfoder.